Τις εργασίες του Συνεδρίου διευθύνει 3μελὲς προεδρείο που απαρτίζεται από τον Πρόεδρο, τον Αντιπρόεδρο και τον Γραμματέα και εκλέγεται από το Συνέδριο µε ανάταση χεριού, ύστερα από πρόταση του Προέδρου του Δ.Σ. της Π.Ο.Ε.- Υ.ΠΑΙ.ΘΑ.
Κατά το Συνέδριο τηρούνται πρακτικά του Προεδρείου, για τις εργασίες που έγιναν και τις αποφάσεις που πάρθηκαν και τις ψηφοφορίες, που καταχωρούνται και υπογράφονται από το προεδρείο του συνεδρίου στο οικείο βιβλίο του Συνεδρίου .
Το προεδρείο ευθύνεται για την ομαλή διεξαγωγή των εργασιών του Συνεδρίου, της ψηφοφορίας και το απόρρητο αυτής και επιλύει τις όποιες διαφορές παρουσιασθούν.
Το Συνέδριο αποφασίζει πάντα µε φανερή ή μυστική ψηφοφορία, ποτέ όμως δια βοής.
Κατά τη συζήτηση θεμάτων λογοδοσίας του Δ.Σ. (διοικητική-οικονομική) είναι υποχρεωτική η παρουσία των µελών του Δ.Σ. και της Ε. Ε..
Το Συνέδριο µε απόφαση της πλειοψηφίας της µπορεί να συζητήσει και οποιοδήποτε εκτός της ημερήσιας διάταξης θέμα.
Το προεδρείο παραμένει ως την λήξη του συνεδρίου και παραδίδει το υλικό στο νέο Δ.Σ. ἡ στον πλειοψηφήσαντα σύμβουλο. Επίσης παραμένουν έως την λήξη των εργασιών της συνέλευσης και οι Πρόεδρος, Γενικός Γραμματέας και Ταμίας του απερχόμενου Δ.Σ.